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汚染された土壌や地下水などに、既にそこに生息している微生物に栄養を与えて活性化させ、汚染物質の分解促進を図り、浄化する方法。具体的には、空気を吹き込んだり、栄養塩(窒素・リン)や有機物(基質など)を注入し、微生物の活性化を利用して浄化を行う。一方、バイオオグメンテーションは、汚染された土壌や地下水に、効果のある微生物を注入して浄化を行う技術。