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微生物探索技術における遺伝子工学的手法の一つ。PCR(ポリメラーゼ連鎖反応:DNA(デオキシリボ核酸の略称で、遺伝子の本体として生物の核内に存在する物質)を増幅するための原理または手法のことで、手法を指す場合はPCR法という)により各種微生物由来のDNAを増幅し、電気泳動を用いて各DNAを分離する。次に、分離したDNA配列を解析し、経時的にどのような微生物が増殖あるいは死滅しているかを評価する手法。